مطالعه بیوانفورماتیک و طراحی کاندید واکسن چند اپی توپی علیه SARS-CoV-2
Bioinformatics study and design of a candidate for multi-epitope vaccine against SARS-CoV-2
نویسندگان :
حسین سمیعی ابیانه ( دانشگاه جامع امام حسین )
چکیده
بیماری همه گیر کووید-19(COVID-19) یک تهدید جهانی است که توسط ویروس سندرم حاد تنفسی 2 (SARS-CoV-2) ایجاد می شود. بیماری کووید-19 با علائمی از جمله تنگی نفس ، تب، درد عضلانی شناخت می شود. طبق آمار رسمی سازمان بهداشت جهانی تعداد مبتلایان، بهبود یافتگان و فوتشدگان ثبت شده تا 15 آذر سال 1400 به ترتیب 265525077 و 237,088,828 و 5,262,759 نفر بوده که این آمار در کشور ایران که رتبه نهم را در جهان از نظز تعداد مبتلایان دارد به ترتیب 6131356 و 5,916,199 و 130,124 نفر بود. در مطالعه حاضر، یک واکسن جدید چند اپی توپی با استفاده از ابزارهای in silico طراحی شده است که به طور بالقوه پاسخ های ایمنی سلول های T (CD4 و CD8) را در برابر کروناویروس جدید تحریک می کند.این کاندید واکسن با استفاده از اپی توپ های سلول B و T طراحی شده است که می تواند به عنوان یک ایمونوژن عمل کند و پاسخ ایمنی را در سیستم میزبان ایجاد کند. توالی مرتبط با پروتئین اسپایک سویههای جدید ویروس کرونا (SARS-CoV-2) از سرور GeneBank، دریافت شد. سرور VaxiJen مهمترین ایمونوژن از بین تمام پروتئین ها را غربال کرد و سرور IEDB پیش بینی و تجزیه و تحلیل اپی توپ های سلول B و T را ارائه ارائه داد. در نهایت اپیتوپ ها با استفاده از لینکر مناسب به هم متصل شدند. نتایج تحت مطالعات مدلسازی و داکینگ واکسن تایید شد. مطالعه داکینگ مولکولی برهمکنشهای اتصال پروتین-پروتئین بین ساختار واکسن و گیرنده ایمنی TLR-3 را نشان داد. شبیهسازیهای MD پایداری وضعیت اتصال را تایید کرد. نتایج شبیه سازی ایمنی پاسخ قابل توجهی را برای سلول های ایمنی نشان داد. یافتههای این مطالعه تأیید کرد که ساختار نهایی واکسن پپتید کایمریک میتواند پاسخ ایمنی علیه nCoV-19 را تقویت کند.کليدواژه ها
بیوانفورماتیک، واکسن چند اپیتوپی، کووید-19، سندرم حاد تنفسی2، ویروس سارس کوو2کد مقاله / لینک ثابت به این مقاله
برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است :نحوه استناد به مقاله
در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:حسین سمیعی ابیانه , 1400 , مطالعه بیوانفورماتیک و طراحی کاندید واکسن چند اپی توپی علیه SARS-CoV-2 , نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی
برگرفته از رویداد
دیگر مقالات این رویداد
© کلیه حقوق متعلق به دانشگاه دامغان میباشد.