چکیده

مطالعه ی هم خوانی سراسر ژنوم، از حوزه های مهم در بیوانفورماتیک در راستای کشف ارتباط بین بیماری ها و نوع خاصی از تنوع ژنتیکی است. از چالش های مطالعه ی هم-خوانی سراسر ژنوم، وجود ژنوتیپ های گمشده است. روش تکمیل ماتریس با مرتبه ی پایین از روش های مشهور و موفق در این کاربرد است. هدف این روش، کمینه سازی مرتبه ی ماتریس داده است. از آن جا که مساله ی بهینه سازی مربوطه محدب نیست از تقریب هایی استفاده می شود که کارایی لازم را ندارد. این روش ها در مواجهه با زمانی که تعداد داده های گمشده زیاد باشد موفق نبوده و نیز به اندازه ی کافی مقیاس پذیر نیستند. در این مقاله روش حداقل مربعات بازموزون تکراری که دو چالش بیان شده را در نظر گرفته است، جهت مطالعه ی هم خوانی سراسر ژنوم اعمال شده است. این روش روی مجموعه داده ی استاندارد مورد ارزیابی قرار گرفته و بر اساس ملاک های خطای فریبیوس و خطای فریبیوس نسبی مورد ارزیابی قرار گرفته است. نتایج بدست آمده کارایی روش پیشنهای در مقایسه با روش های مشابه را تایید می کند.

کليدواژه ها

مطالعه ی هم خوانی سراسر ژنوم، تکمیل ماتریس رتبه پایین، جایگذاری داده های گمشده، روش حداقل مربعات بازموزون تکراری

کد مقاله / لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است :

نحوه استناد به مقاله

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
زهره کریمی , 1400 , بهبود کارایی تکمیل داده های مفقود شده در مطالعه ی هم خوانی سراسر ژنوم , نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی