پورتال همایش های دانشگاه دامغان
  • صفحه اصلی
  • اخبار
  • گالري عکس
  • سایت دانشگاه
  • تماس با ما
Bootstrap Touch Slider
  1. :. صفحه اصلی
  2. آرشیو مقالات رویداد ها
  3. مجموعه مقالات نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی
  4. مقاله ارزیابی بیوانفورماتیک مسیرهای اینترفرون نوع I در افراد آلوده به SARS-CoV-2 بر اساس داده های ریزآرایه
عنوان رویداد : نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی
تاریخ برگزاری : 29 دي ماه 1400

ارزیابی بیوانفورماتیک مسیرهای اینترفرون نوع I در افراد آلوده به SARS-CoV-2 بر اساس داده های ریزآرایه

Bioinformatics Evalution of TypeI Interferon Pathways in SARS-CoV-2-infected Individuals Based on Microarray Data
نویسندگان :

ملیحه حسین پور ( دانشگاه اراک )

دانلود فایل   

چکیده

Abstract Background: Coronavirus 2019 (COVID-19) is caused by severe coronavirus 2 acute respiratory syndrome (SARS-CoV-2). Type 1 interferons (IFN-1) are a group of cytokines with non-specific antiviral and immunomodulatory properties. They include subgroups α and β, among others (ε, ω, κ). Interferons-α (IFNα) and -β (IFNβ) have been suggested as candidates for COVID-19 drug therapy. This study aimed to investigate the rate of expression in case and control samples through bioinformatics analysis of public datasets. Materials and Methods: In this study the gene expression datasets has obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. A total of 36 series about human coronavirus were retrieved from the database. After a review, microarray gene expression dataset with the accession number of GSE177477 were selected. This dataset contains 11 COVID-19 symptomatic cases and 18 healthy Controls in CEL format on the GPL23159 platform. The GEO2R tool used to screen out the rate of expression, and the adjusted P-value and |logFC| calculated. Next, all the differentially expressed genes (DEGs) that met the cutoff criteria, adjusted P˂0.05, considered as DEGs. Results: In the present study, gene expression analysis based on publicly available databases was performed. Analysis of microarray data on type I interferon pathways indicated that the rate of expression in COVID-19 symptomatic cases was higher in order to healthy Controls. Conclusions: Bioinformatics analysis can use as a diagnostic procedure, and also identyfing host protective mechanisms against SARS-CoV-2 infection can help improve COVID-19 treatment. Key Words: COVID-19 ، Gene expression ،Microarray Analysis . REFERENCES 1. Barrett T, Edgar R. [19] Gene expression omnibus: microarray data storage, submission, retrieval, and analysis. Methods in enzymology, 1;411:352-69 , Jan 2006. 2. Masood KI, Yameen M, Ashraf J, Shahid S, Mahmood SF, Nasir A, Nasir N, Jamil B, Ghanchi NK, Khanum I, Razzak SA. Upregulated type I interferon responses in asymptomatic COVID-19 infection are associated with improved clinical outcome. Scientific reports, 25;11(1):1-4, Nov 2021. 3. Lam S, Lombardi A, Ouanounou A. COVID-19: A review of the proposed pharmacological treatments. European journal of pharmacology, 5;886:173451, Nov 2020.

کليدواژه ها

COVID-19، Gene expression، Microarray Analysis

کد مقاله / لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است :

نحوه استناد به مقاله

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
ملیحه حسین پور , 1400 , ارزیابی بیوانفورماتیک مسیرهای اینترفرون نوع I در افراد آلوده به SARS-CoV-2 بر اساس داده های ریزآرایه , نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی

برگرفته از رویداد



نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی
تاریخ برگزاری : 29 دي ماه 1400


دیگر مقالات این رویداد

  • مقایسه نانوشیلد سربی با شیلد سربی متداول برای پرتو الکترون 6 مگاالکترون ولت
  • بازسازی سیگنال مغز با استفاده از توابع پایه ای شعاعی اسپلاین هموار و اسپلاین خطی
  • ارائه رویکردی مبتنی بر تبدیل قیچک برای پردازش تصاویر پزشکی
  • بررسی همبستگی ذرات معلق و آیروسل های زیستی با انتقال ویروس SARS-CoV-2 و استخراج قوانین موثر
  • طراحی لیگاند مهاری جدید بر پایه برخی تری پپتیدهای طبیعی جهت مهار آنزیم تبدیل کننده آنژیوتانسین در بیماران مبتلا به کووید19 توسط نرم افزارهای بیوانفورماتیک
  • مدل بیضوی برای رشد تومورها با وجود رگزایی
  • مطالعه ی طولی میزان نقص توجه- بیش فعالی بر اساس پرسشنامه ی کانرز در دانشجویان دانشگاه صنعتی امیرکبیر
  • عملکرد داروهای سیتوتوکسیک در دو حالت بنگ بنگ و پیوسته
  • جمعیت پاتوژنها و معادله ریکاتی
  • بررسی اتصال لاپاتینیب به نانوذرات آلبومین توسط FTIR
  • تماس با ما


    نشانی: دامغان، میدان دانشگاه، دانشگاه دامغان
    پست الکترونیکی: pr@du.ac.ir
    مرکز تلفن دانشگاه: ۶-۳۵۲۲۰۰۸۱ ۰۲۳
    نمابر: ۳۵۲۲۰۱۲۰
    کد پستی: ۴۱۱۶۷ – ۳۶۷۱۶
    تلفکس روابط عمومی: ۳۵۲۲۰۲۴۹ ۰۲۳

    © کلیه حقوق متعلق به دانشگاه دامغان می‌باشد.

    همایش نگار (نسخه 10.0.12)    [مدیریت سایت]