پورتال همایش های دانشگاه دامغان
  • صفحه اصلی
  • اخبار
  • گالري عکس
  • سایت دانشگاه
  • تماس با ما
Bootstrap Touch Slider
  1. :. صفحه اصلی
  2. آرشیو مقالات رویداد ها
  3. مجموعه مقالات نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی
  4. مقاله پیش‌بینی میل اتصال آپتامر به ویروس آنفولانزا با استفاده از شبکه عصبی
عنوان رویداد : نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی
تاریخ برگزاری : 29 دي ماه 1400

پیش‌بینی میل اتصال آپتامر به ویروس آنفولانزا با استفاده از شبکه عصبی

Prediction of specific binding affinity of aptamers to the influenza virus using Neural Network
نویسندگان :

فاطمه شعاع اردبیلی ( گروه بیوفناوری دانشکده علوم و فناوری‌های نوین، دانشگاه سمنان ) , امین جانقربانی ( گروه بیوفناوری دانشکده علوم و فناوری‌های نوین، دانشگاه سمنان، ) , احمدفرهاد طالبی ( گروه بیوفناوری دانشکده علوم و فناوری‌های نوین، دانشگاه سمنان، )

دانلود فایل   

چکیده

ویروس آنفولانزا سالانه باعث مرگ تعداد زیادی انسان و حیوان در سراسر جهان می‌شود و به خسارات اقتصادی چشمگیری منجر می‌شود. توسعه روش‌های تشخیصی مطمئن، موثر، سریع و با حساسیت بالا، امکان کنترل همه گیری و مواجه با خسارات را فراهم می‌کند. با توجه به پتانسیل بالای کاربرد آپتامرها در تشخیص، کنترل و حتی درمان عفونت آنفولانزا، معرفی روش های مولکولی نوین براساس این الیگونوکلئوتیدهای متصل‌شونده به ذرات ویروسی مورد توجه قرار گرفته است. با توجه به توان بالای محاسبات هوش مصنوعی، طراحی و استخراج ویژگی‌های آپتامرهای اختصاصی ویروس آنفولانزا در مطالعه حاضر به اجرا رسیده است. در این پژوهش با استفاده از شبکه‌های عصبی میزان تمایل اتصال آپتامرها و ویروس آنفولانزا مدل‌سازی شده‌است. مجموعه داده این مقاله شامل ۹ ویژگی‌های ساختار مولکولی 96 آپتامر به عنوان توصیف‌گر و میزان تمایل اتصال آن‌ها به ویروس آنفولانزا به عنوان متغیر مستقل است. در این مقاله از دو نوع شبکه‌ عصبی MLP و GRNN برای پیش‌بینی میل اتصال آپتامرها بهره گرفته شد. برای رسیدن به این هدف ۹ ویژگی بیان شده به عنوان ورودی‌های شبکه و میزان میل اتصال به عنوان خروجی شبکه در نظر گرفته شد. بعد از آموزش شبکه‌های عصبی با استفاده از دادگان آموزش دقت پیش‌بینی میل اتصال در شبکه عصبی GRNN برای دادگان آزمون و براساس معیار r2 مقدار 0.64 بدست آمده است. همین فرآیند برای شبکه عصبی MLP تکرار شد عملکرد این شبکه در پیش بینی میل اتصال در دادگان آزمون r2=0.77 حاصل شد. نتایج حاصل از این روش‌ها در مقایسه با روش رگرسیون چند خطی با مقدار r2=0.66 نشان از برتری مدل MLP‌ در پیش‌بینی میل اتصال آپتامر‌ها به ویروس آنفولانزاست.

کليدواژه ها

آپتامر، ویروس آنفولانزا، میل اتصال، پیش‌بینی، هوش مصنوعی شبکه‌های عصبی، زیست‌محاسباتی

کد مقاله / لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است :

نحوه استناد به مقاله

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
امین جانقربانی , 1400 , پیش‌بینی میل اتصال آپتامر به ویروس آنفولانزا با استفاده از شبکه عصبی , نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی

برگرفته از رویداد



نخستین همایش بین المللی و سومین همایش ملی ریاضیات زیستی
تاریخ برگزاری : 29 دي ماه 1400


دیگر مقالات این رویداد

  • بررسي یک مدل "SIS" وتحلیل پایداری نقاط تعادل آن
  • ارزیابی مدل ریاضی همبستگی بین تصاویر ماهواره TRMM و داده های ایستگاههای زمینی
  • سگمنتیشن کاملاً خودکار مناطق پروستات در تصاویر DW-MR با استفاده از مدل U-Net
  • بررسی ارتباط بین آلودگی هوا و تعداد بیماران قلبی-عروقی و تنفسی ثبت شده در بیمارستان های استان همدان در سال 1393
  • خوشه بندی راهنماییده مجموعه داده های ژنی
  • حل عددی معادله نیوول - وایتهد – سیگل
  • نسبتهای فیبوناتچی و رشد جمعیت بیولوژیک
  • توزیعی برای زمان بهبودی بیماران مبتلا به سرطان مثانه
  • شناسایی چرخه حدی تیروئید در داده های واقعی
  • اثر ضددردی 17 بتا استرادیول از طریق گیرنده AMPA: مطالعه داکینگ مولکولی
  • تماس با ما


    نشانی: دامغان، میدان دانشگاه، دانشگاه دامغان
    پست الکترونیکی: pr@du.ac.ir
    مرکز تلفن دانشگاه: ۶-۳۵۲۲۰۰۸۱ ۰۲۳
    نمابر: ۳۵۲۲۰۱۲۰
    کد پستی: ۴۱۱۶۷ – ۳۶۷۱۶
    تلفکس روابط عمومی: ۳۵۲۲۰۲۴۹ ۰۲۳

    © کلیه حقوق متعلق به دانشگاه دامغان می‌باشد.

    همایش نگار (نسخه 10.0.12)    [مدیریت سایت]